Die Tauchgänge werden von erfahrenen Tauchlehrern und Tauchguides geplant und begleitet. Je nach Ankunftszeit wird schon am Ankunftstag ein Checktauchgang angeboten, an den folgenden Tagen Tauchtagen stehen 2-3 Tauchgänge auf dem Programm. 

Für die Teilnahme an den Kreuzfahrten wird eine Erfahrung von mind. 40 Tauchgängen vorausgesetzt. Erfahrende Taucher dürfen die Tauchgänge im Buddy Team durchführen, wenn die Tauchguides dies genehmigen.

Getaucht wird nach einem ausführlichen Briefing in englischer oder deutscher Sprache von dem begleitenden Tauchdhoni mit 12 Liter Aluflaschen. Auf dem Tauchdhoni wird auch die Tauchausrüstung gelagert und hier werden die Flaschen gefüllt, zur Verfügung stehen Flaschen mit DIN- und Int Ventil. Das Tauchdhoni folgt den Tauchern bei den Tauchgängen und nimmt holt diese nach dem Tauchen wieder ab, es gibt eine bequeme Leiter über die man das Wasser verlässt. 

Die Nautilus Two fährt überwiegend in den Zentralen Atollen der Malediven ab/bis Male. Die Tauchplätze hier sind sehr abwechslungsreich, Kanaltauchen mit Strömung, Mantas an Putzerstationen, viele Riffhaie und große Fischschwärme wird der Taucher mit ziemlicher Sicherheit im Rahmen einer Kreuzfahrt sehen.